Keyword(s): Genome mining
-
Jon Clardy, PhD
Isolation and characterization of small molecule natural products; high-throughput screening for novel therapeutics
Discovering small molecule, natural products and their biology; high throughput screening for small molecule chemicals that interfere with microbial and mammalian cell processes.

Research Categories
Sub-categories
-
Biologic Specialties (i.e., -ologies; -omics):
- Bacteriology»
- Bioengineering»
- Bioinformatics»
- Cell-type specific gene expression»
- Chemical biology»
- Chemical ecology»
- Comparative pathology»
- Computational biology»
- Computational genomics»
- Connectomics»
- Developmental biology»
- Electrophysiology»
- Environmental regulation»
- Evolution»
- Functional genomics»
- Genetics»
- Genome mining»
- Genomics»
- Immunology»
- Infectious disease»
- Metabolomics»
- Microbial biology»
- Microbial ecology»
- Microbial genetics»
- Microbial genomics»
- Molecular biology»
- Neural circuits»
- Neurobiology»
- Neuronal cell biology»
- Nutrition»
- Oncology»
- Physiology»
- Polymer science»
- Population demographic»
- Proteomics»
- Retina genetics»
- Retinal metabolism»
- Synthetic biology»
- Systems Biology»
- Technology»
- Transcriptome»
- Tumor biology»
- Vascular biology»
-
Molecular Techniques and Experimental Approaches
- 3-dimensional basement membrane cell cultures»
- Atomic resolution»
- Automated DNA sequencing»
- Biofuel»
- Biomarker»
- BRET»
- Cancer therapy»
- Cell cycle arrest»
- Chemical detection of cell proliferation»
- ChIP»
- Chromatin immunoprecipitation»
- Computational infrastructure/tools»
- Computational modeling»
- Conditional targeted cell ablation»
- Cross-fire irradiation»
- Cryoelectron microscopy»
- Cryoelectron tomography»
- Data mining»
- DNA nanotechnology»
- DNA sequencing»
- Experimental yeast genetics»
- Extinction therapy»
- FISH»
- Fluorescent imaging of cell proliferation»
- Fluorescent In Situ Hybridization»
- FRET»
- Gene knockdown»
- Gene therapy»
- Genetic engineering»
- Genetic pulldown»
- Genetic screen»
- Genome mining»
- Global molecular profiling»
- Heterologous protein expression»
- High resolution structure»
- High throughput»
- Humanized yeast»
- Immune reconstitution»
- Immunotherapy»
- In silico molecular modeling»
- Liposome»
- Live cell imaging»
- Live cells imaging»
- luciferase»
- Mathematical modeling»
- Membrane protein reconstitution»
- Methods development»
- Microarray»
- Microfluidics»
- Molecular modeling»
- Molecular sensor»
- Multiplexing»
- Natural products»
- NMR spectroscopy»
- Optogenetics»
- Patch clamping»
- Personal genome»
- Phenotypic screen»
- Polony DNA sequencing»
- Probabilistic decision tree»
- Radioiodination»
- Radionuclide»
- Recombinant viral vector»
- RNA inhibition»
- RNA interference»
- RNAi»
- Single molecule imaging»
- Single-cell measurement»
- Single-cycle SIV»
- siRNA screen»
- Stem cell gene therapy»
- Synthetic biology»
- Technology development»
- Tissue engineering»
- Tumor immunotherapy»
- Viral entry imaging»
- Virus-membrane complex reconstitution»
- X-ray crystallography»
-
Research Tools; Animal and Cell Models; Unique Resources
- 3-dimensional basement membrane cell cultures»
- Adeno-associated virus (AAV)»
- Alexa Fluor dyes»
- Artificial tether»
- Auditory enrichment»
- Automated zebrafish screening»
- Automation»
- Behavior model»
- Biocomputational methods»
- Bioinformatics»
- Brain plasticity»
- Brainbow system»
- C. elegans»
- Ca2+-GFP-Aequorin»
- Calcium indicators»
- cDNA libraries from single neurons»
- cell culture in linear micro-colonies»
- Cell-based assays»
- Cellular ablation»
- Computer-assisted image analysis»
- Cryo-Electron Tomography»
- Cyanobacteria»
- Drosophila»
- Drosophila RNAi Screening Center»
- Escape behavior»
- Escherichia coli (E. coli)»
- FACS analysis»
- Genetically-encoded biosensor»
- Genome mining»
- High resolution transcriptome sequencing»
- High Throughput Screening»
- Human cells»
- Insomnia model»
- Interactive computer software»
- Knockout mouse»
- Lab-On-A-Chip»
- Mammalian cells»
- Microorganism»
- Molecular modeling»
- Monkey»
- Mouse behavior»
- Mouse imaging»
- Mouse models»
- Mouse tumor models»
- Multiphoton laser scanning microscopy»
- Natural host»
- Neuronal recordings»
- Non-human primate»
- Odor map»
- Odor-guided perceptual decision task»
- OMP-ChR2 mice»
- Optogenetics»
- Physics»
- Primate Model»
- Protein and small molecule production»
- Rabies vector»
- Recombinant toxins»
- Retrogenic mouse»
- Retroviral vector»
- Reward-based decision making and learning»
- Reward-based learning and decision-making assays»
- Rhesus macaque»
- S. cerevisiae»
- S. pombe»
- Short and long-term olfactory memory tests»
- Sooty mangabey»
- SpH mice»
- Tissue engineering»
- Transcriptome comparisons»
- Transgenic mice»
- Transgenic mouse»
- Transgenic zebrafish»
- Video microscopy»
- Visual deprivation»
- Widefield FCS»
- Xenopus tadpoles»
- Yeast»
- Yeast microbiology»
- Zebrafish larvae»
- Zebrafish models»