Research Categories - Biological Mechanisms and Pathways
Related Investigators
- Page:
-
John Flanagan, PhD
Molecular analysis of axon guidance
Investigate molecular mechanisms of axonal guidance, including the continuum of axon response to guidance cues, and the corresponding receptor-mediated signaling.

-
Walter Fontana, PhD
Information biology: principles, limits, and evolution of information processing in molecular systems
Develop, apply, and establish the concept of programs as models to represent, model, and analyze complex systems of molecular interactions underlying cellular behavior; empirically characterize and ...

-
Rachelle Gaudet, PhD
Structural biology of ion channels and transporters
X-ray crystallography and other biophysical and biochemical techniques are applied to study the stereochemistry of signaling and transport through biological membranes. Research interests include the ...

-
Karine Gibbs, PhD
Explores Identity and Territory in the Social World of Bacteria
Investigate the molecular mechanisms underlying the ability of bacterial cells to discriminate self from non-self; study the bacterium Proteus mirabilis, a Gram-negative opportunistic pathogen that ...

-
Jeremy Gunawardena, PhD
Experimental and theoretical analysis of signal transduction: EGF signaling, drug efficacy, phosphorylation states, microfluidics, formalized biology language
Investigate the dynamics of signal transduction, from a mechanistic and practical perspective. Describe at a fundamental level the input/output transformation that connects external signals to ...

-
Marcia Haigis, PhD
Mitochondrial dysfunction in aging and disease: bioenergetics, metabolomics, and cell stress
Study the role of the sirtuins in metabolism, aging, and disease

-
Jose Halperin, MD
Targeting protein translation for anticancer therapies; CD59 and diabetes
Employ the preclinical resources of the Laboratory for Translational Research to develop new therapies and diagnostics in oncology and diabetes

-
Takao K. Hensch, PhD
Critical periods in brain development
Dr. Hensch’s research focuses on critical periods during brain development and has a broad impact on both basic understanding of cognitive disorders and therapeutic approaches to them. By ...

-
James Hogle, PhD
Virus structure, mechanism of entry into cells, and replication
Perform studies on poliovirus infection; investigate the proteomic composition of virus-laden membrane vesicles; study the herpes simplex virus replication complex and nuclear egress ...

-
Peter Howley, MD
Papillomavirus biology
Investigate the activities of papillomavirus-encoded proteins, including the E6-mediated degradation of p53 and E2-mediated regulation of viral transcription and genome replication

Sub-categories
-
Anatomy/Molecular Elements
- Active zone»
- Axon»
- Bone»
- Bone marrow»
- Calcium channel»
- Cellular motor»
- Central Nervous System»
- Central Nervous System (CNS)»
- Chromatin»
- Chromatin structure»
- CNS»
- Cytoskeleton»
- Dendrite»
- Dopaminergic neuron»
- Epithelial»
- Extracellular matrix»
- Gene cluster»
- Genital track»
- Genome»
- Glomeruli»
- Growth cone»
- Gut»
- Hypothalamus»
- Immunological synapse»
- Ion channel»
- Lipid bilayer»
- Liver»
- Lymph-tissue interface»
- mar operon»
- Microtubules»
- Mitochondria»
- Molecular motor»
- Mucosal surface»
- Multipotent progenitor cell»
- Muscle growth»
- Nervous system»
- Neural mapping»
- Neural network»
- Neural outgrowth»
- Neuromuscular junction»
- Neuron»
- Neuropathology»
- Nuclear organization»
- Nucleosome»
- Olfactory bulb»
- Pain-sensing neuron»
- Photoreceptor»
- Photoreceptor cell»
- Potassium channel»
- Prefontal cortex»
- Presynaptic terminal»
- Promoter»
- Proteasome»
- Protein structure»
- Proton channel»
- Retina»
- Retina patterning»
- Retinal amacrine cells»
- Retinal bipolar cell»
- Retinal ganglion cells»
- Retinal horizontal cell»
- Sensory neuron»
- Sodium channel»
- Striatum»
- Suprachiasmatic nucleus (SCN)»
- Synapse»
- Synaptic scaffold»
- Ternary complex»
- Transcription factor binding site»
- Transient receptor potential C2 channel (TRPC2)»
- TRPV1 channel»
- UCE»
- Ultraconserved Elements»
- Viral channel»
- Vomeronasal organ»
-
Biologic Specialties (i.e., -ologies; -omics):
- Bacteriology»
- Bioengineering»
- Bioinformatics»
- Cell-type specific gene expression»
- Chemical biology»
- Chemical ecology»
- Comparative pathology»
- Computational biology»
- Computational genomics»
- Connectomics»
- Developmental biology»
- Electrophysiology»
- Environmental regulation»
- Evolution»
- Functional genomics»
- Genetics»
- Genome mining»
- Genomics»
- Immunology»
- Infectious disease»
- Metabolomics»
- Microbial biology»
- Microbial ecology»
- Microbial genetics»
- Microbial genomics»
- Molecular biology»
- Neural circuits»
- Neurobiology»
- Neuronal cell biology»
- Nutrition»
- Oncology»
- Physiology»
- Polymer science»
- Population demographic»
- Proteomics»
- Retina genetics»
- Retinal metabolism»
- Synthetic biology»
- Systems Biology»
- Technology»
- Transcriptome»
- Tumor biology»
- Vascular biology»
-
Cell Growth
-
Cell Types
- Antigen Presenting Cell (APC)»
- Astrocyte»
- B-cell»
- B-lymphocyte»
- Cancer stem cell»
- Cell morphology»
- Dendritic cell»
- Endothelial cell»
- Epithelial cell»
- Hematopoietic Stem and Progenitor Cell (HSPS)»
- Hematopoietic Stem Cell»
- HSC»
- HSPC differentiation»
- Immune cell»
- Leukocyte»
- Lymphocyte»
- Macrophage»
- Megakaryocyte»
- Muller glial cell»
- Platelet»
- Regulatory T-cell»
- Soil microbe»
- T-cell»
- T-lymphocyte»
-
Genetics
- aneuploidy»
- CNV»
- Copy number variant»
- Epigenetics»
- Gene Amplification»
- Genome Stability»
- Genomic imprinting»
- Intergenetic DNA»
- mar operon»
- Negative feedback»
- Personal Genetics Education Project (http://www.pged.org/)»
- Recombination»
- S. pombe»
- Ultraconserved Elements»
- Upstream Activation Sequence»
- Yeast genetics»
-
Molecular/Cellular/Viral
- Acquired immunity»
- Adaptive immunity»
- Alternative splicing»
- Angiogenesis»
- Anoikis»
- Apoptosis»
- Autocrine cascade»
- Axon guidance»
- Axonal transport»
- Bioenergetics»
- Biological circuitry»
- Blood coagulation»
- Cancer metabolism»
- Cell adhesion»
- Cell death»
- Cell differentiation»
- Cell division»
- Cell invasion»
- Cell migration»
- Cell stress»
- Cell-cell signaling»
- Cellular memory»
- Cellular morphogenesis»
- Chemoresistance»
- Chromosome segregation»
- Chromosome X inactivation»
- Circadian rhythm»
- Complement-mediated immune reaction»
- Development»
- DNA damage»
- DNA damage repair»
- DNA Replication»
- DNA-binding epigenetics»
- Drug resistance»
- Dynamics»
- Electrical signaling»
- Entosis»
- Epigenetics»
- Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT)»
- Eukaryotic gene expression»
- Eukaryotic protein translation initiation»
- Eukaryotic regulatory networks»
- Feedback loop»
- Gene evolution»
- Gene expression»
- Gene function»
- Gene homology»
- Gene regulation»
- Genetic interactions»
- Genetic pathways»
- Genome translocation»
- Histone code»
- HIV immune response»
- Homing»
- Homologue pairing»
- Immune evasion»
- Immune response»
- Immune suppression»
- Immune tolerance»
- Immunity»
- Infectivity»
- Inflammation»
- Innate immunity»
- Intercellular signaling»
- Lumen formation»
- Macromolecular interaction»
- Mechanisms of protective immunity»
- Membrane fusion»
- Membrane permeability»
- Metabolism»
- Mitochondrial dysfunction»
- Mitogenic signaling»
- Mitosis»
- Molecular information processing»
- Morphogenesis»
- Mother-to-child transmission»
- Motor protein»
- mRNA export»
- mRNA splicing»
- Mucosal immunity»
- Mucosal transmission»
- Networks»
- Neuronal connectivity»
- Neuronal differentiation»
- Neuronal morphogenesis»
- Non-catalytic activity»
- Non-ribosomal peptide synthesis»
- Nuclear egress»
- Nuclear translocation»
- Nutrient stress»
- Oncogenic signaling»
- Osmotic stress»
- Oxidative stress»
- Pathogenesis»
- Persistent infection»
- Pheromone recognition»
- Physics and mechanics of chromosome dynamics»
- Protein degradation»
- Protein folding»
- Protein interactions»
- Protein misfolding»
- Protein secretion»
- Protein trafficking»
- Redox cycle»
- Regional immunity»
- Regulatory networks»
- Regulatory pathway»
- Replication»
- Ribosome biogenesis»
- Secretory pathway»
- Signaling network»
- SinR and SirR pathway»
- Stress response»
- T lymphopoiesis»
- T-cell activation»
- Thrombopoiesis»
- Trafficking»
- Trans gene regulation»
- Transcription»
- Transcription regulation»
- Translational control»
- Transvection»
- Viral endocytosis»
- Viral entry»
- Viral fusion»
- Viral replication»
- Viral structure»
- Virus infection»
- Virus neutralization»
- Virus reactivation»
-
Molecules (Proteins and Non-Proteins) and Molecular Domains
- ABC transporters»
- ACE2»
- Actin»
- Amyloid precursor protein»
- Anaphase-Promoting Complex»
- Antigen»
- Antioxidant»
- Ask1»
- ATP-sensitive potassium channel»
- B7»
- Bacterial extracellular matrix»
- Beta-catenin»
- Calcineurin»
- Calcium/Calmodulin-dependent Kinase II (CaMKII)»
- CCR5»
- CD28»
- CD4»
- CD59»
- Cdc20»
- Cell adhesion»
- Cellular receptor»
- Channelrhodopsin-2»
- Chaperones»
- Chemokine»
- Chondroitin sulphate proteoglycan»
- Cis and trans elements»
- Complement»
- Core particle»
- Costimulatory molecule»
- CTLA-4»
- Cytokine»
- D-amino acids»
- Deacetylase»
- Disulfide reductase»
- DNA helicase»
- DNA Polymerase»
- DNA primase»
- Dopamine»
- Dopamine receptor»
- Dynein»
- EGF»
- eIF4F»
- Electron transporter»
- Envelope protein»
- Ephrin»
- Extracellular hydrolases»
- Fatty acids»
- G-protein coupled receptor (GPCR)»
- GABA»
- GABA receptor»
- Gli»
- Glucose»
- Glutamate»
- Glycine»
- Glycine receptor»
- gp120»
- GPI-linked membrane protein»
- Hedgehog»
- Heparin sulfate proteoglycans»
- Histone»
- Histone deacetylase»
- Histone demethylase»
- Homeoprotein»
- Hydrogen»
- Hypocretin (Hcrt)»
- Initiation factor»
- Interferon»
- Interleukin-8»
- Intermedilysin»
- Kinesin»
- Mad2»
- MAP kinase»
- Mechanochemical enzyme»
- Membrane attack complex»
- Membrane protein»
- Membrane proteins»
- MHC»
- Mitogen-activated protein kinase»
- mTOR»
- N-acetyl aspartate»
- NAD(+)»
- Nef»
- NF-κB»
- Nicotinic acetylcholine receptor»
- Nitrogen»
- NMDA receptor»
- Notch»
- NRAMP transporters»
- Oncogene»
- Ornithine Decarboxylase (ODC)»
- Orphan receptor»
- Otx2»
- Oxygen»
- p53»
- Pacemaker channel»
- Parvalbumin»
- Patched»
- PD-1»
- Phosphatase»
- Phosphatidylinositol 3-kinase»
- Processivity factor»
- protease (tissue-type plasminogen activator)»
- Proteasome»
- Protein kinase»
- Protein phosphatase»
- Protein tyrosine phosphatase»
- Ras»
- Reactive Oxygen Species»
- Receptor»
- Receptor binding domain»
- Receptor tyrosine kinase»
- Ribonuclease»
- Ribonucleotide reductase»
- S6 protein kinase»
- SARS-CoV spike protein»
- Sgo1»
- SID-1»
- SID-2»
- Sirt3»
- Sirt4»
- Sirtuin»
- Small GTPases»
- Sonic Hedgehog (Shh)»
- Sphingosine 1-phosphate»
- Src»
- T-cell receptor (TCR)»
- Target of Rapamycin (TOR)»
- Thioredoxin»
- TNF»
- TNF receptor»
- TRAF2»
- TRP channel»
- Tumor suppressor»
- Tyrosine kinase»
- Tyrosine phosphatase»
- Ubiquitin»
- Ubiquitin ligase»
- Ubp6»
- Variable region»
- Viral receptor»
- Vitamin K epoxide reductase»
- Voltage-activated potassium channel»
- Voltage-gated ion channel»
- Wnt»
-
Organismal
- Abuse liability»
- Aging»
- Bacterial motility»
- Biofilm»
- Biological organization»
- Body composition»
- Calorie restriction»
- Circadian clock»
- Eukaryotes»
- Evolvability»
- Flagellum»
- Illicit drug»
- Interspecies interactions»
- Ketogenic diet»
- Kidney»
- Lifespan»
- Mating behavior»
- Obesity»
- Prevention»
- Prokaryotes»
- Quorum sensing»
- Sleep»
- Social behavior»
- Sporulation»
- Swarming»
- Thermosensation»
- Vision»
-
Protein Degradation
-
Protein Modifications and Interactions
- Acetylation»
- ADP-ribosylation»
- Chaperones»
- Cholesterol modification»
- Cholesterol-modified protein»
- Deubiquitination»
- Disulfide bond»
- Histone acetylation»
- Histone methylation»
- Lynx1-nAChR interaction»
- Phosphorylation»
- Protein phosphorylation»
- Protein-Protein interaction»
- Sumoylation»
- Tyrosine sulfation»
- Ubiquitin conjugate»
- Ubiquitination»
-
RNA metabolism / Translation / Signal Transduction
- dsRNA transport»
- Environmental RNAi»
- Extracellular signaling»
- Gene network»
- Intracellular transport»
- Mating pathways»
- mTOR pathway»
- Multisite phosphorylation»
- Oscillations»
- Pheromone feedback loop»
- Protein translation»
- Reverse translation»
- SAGA»
- Signal transduction»
- TNF»
- Transcriptional activation/repression»
- Translation initiation»
- Translational control and RNA-based regulation»
- Vertebrate/mammalian RNAi»
-
Stem cells